103年9月25日花蓮縣議會第2（財政）審查委員會考察太魯閣峽谷馬拉松的重點是馬拉松路線的安全及觀光效益。太魯閣峽谷馬拉松興辦是2000年適逢中部橫貫公路開通四十週年為了響應各界，倡議為緬懷先人篳路藍縷開闢世界級峽谷景觀道路之艱辛，規劃舉辦國際馬拉松，讓世人認識太魯閣之美並活絡花蓮縣地方經濟發展。「台灣唯一峽谷馬拉松」是花蓮地區的首屆國際馬拉松賽，其目的是讓中外選手在太魯閣峽谷中盡情奔跑，讓遊客與選手得以健康、自由方式親近花蓮縣的太魯閣國家公園，並提高國際知名度。花蓮縣好山好水，與太魯閣地貌鬼斧神工，和太魯閣族原住民豐富的人文內涵，均令人讚嘆。如何使太魯閣成為台灣的景觀地標，並且揚名國際，一直是太魯閣峽谷馬拉松的主要特色。太魯閣馬拉松於每年旅遊淡季的11月舉辦，有助於花蓮觀光產業價值，花蓮縣政府於2003年將太魯閣馬拉松訂為花蓮觀光週、2004年更將太魯閣馬拉松舉辦訂為花蓮觀光月，全力推動花蓮觀光淡季旅遊效益，成果良好並每年舉辦。
太魯閣國家公園峽谷馬拉松是由中華民國路跑協會申請主辦「2013太魯閣峽谷馬拉松」，太魯閣國家公園不需負擔任何經費，由中華民國路跑協會自負盈虧。太魯閣馬拉松2013報名方式採用網路登記，並以抽籤方式抽出正取12000名，其中全馬4000名、半馬8000名，其餘列備取序號，依序號先後次序後補。並於指定時間內完成繳費（全馬800元，半馬700元）方符合參賽資格。免抽籤預留名額以優秀選手（全馬男子成績3小時內、全馬女子成績4小時內、半馬男子成績1小時20分內、半馬女子成績1小時40分內）及連續13年完成太魯閣馬拉松選手為主。
2014太魯閣峽谷馬拉松花蓮縣政府9月22日表示，103年的太魯閣峽谷馬拉松敲定12月13日舉行，一改往年由中華民國路跑協會主導的傳統，由花蓮縣政府主辦、花蓮縣體育會承辦。太魯閣國家公園只是一個景點，峽谷馬拉松是一條線，花蓮縣是一個面。花蓮好山好水，希望風景變鑽石，泥土變黃金，推動運動賽事觀光化，行銷節慶經濟化。